Yap từng là Trung tâm liên lạc Hải quân của Đức trước Chiến tranh Thế giới thứ 1. Nhật Bản chiếm đóng đảo vào tháng 9 năm 1914 và sau đó đảo được chuyển cho Nhật Bản theo Hiệp ước Versailles năm 1919 với danh nghĩa Lãnh thổ ủy trị dưới sự giám sát của Hội Quốc Liên. Quyền thương mại của Hoa Kỳ được bảo đảm theo một Hiệp ước đặc biệt giữa Hoa Kỳ và Nhật Bản có hiệu lực vào ngày 11 tháng năm 1922.

Trong Chến tranh Thế giới thứ 2, Nhật Bản giữ Yap là một trong những hòn đảo chống lại chiến dịch "nhảy cóc" của Hoa Kỳ, mặc dù thường bị tàu và máy bay Hoa Kỳ thả bom. Trong giai đoạn cuối của cuộc chiến, Quân đội Hoa Kỳ đổ bộ lên đảo và sau đó quản lý đảo cùng với phần còn lại của Quần đảo Caroline như là Lãnh thổ ủy trị Quần đảo Thái Bình Dương cho đến năm 1986. Cùng năm đó, Yap, Chuuk, Pohnpei và Kosrae hợp thành một quốc gia độc lập là Liên bang Micronesia. Theo Hiệp ước liên kết tự do với Hoa Kỳ, công dân Micronesia và hàng hóa của nước này được phép di vào Hoa Kỳ với rất ít hạn chế.